La identificación precisa de cerdos es esencial en la agricultura inteligente, sin embargo, las cercas y otros obstáculos a menudo bloquean características faciales críticas, reduciendo significativamente la precisión del reconocimiento, especialmente dada la alta similitud entre los cerdos individuales. Para abordar estos desafíos, proponemos un sistema de reconocimiento y restauración de rostros de cerdos en tres etapas (PigFRIS), que integra un módulo de segmentación de oclusión de cercas (YOLOv11L), un modelo de restauración basado en GAN (AOT-GAN) para restaurar regiones ocluidas, y un componente de reconocimiento EfficientNet-B2 para una clasificación robusta de cerdos. Al detectar y corregir con precisión las características faltantes, PigFRIS desplaza el enfoque de las pistas incidentales a los atributos faciales genuinos del cerdo, ofreciendo un reconocimiento fiable incluso en entornos agrícolas altamente obstruidos.