Se han construido embalses en casi todas las cuencas hidrográficas de Brasil. Sus propósitos incluyen el abastecimiento de agua a las ciudades, el riego y, principalmente, la generación de electricidad. Existen más de 700 grandes presas y embalses asociados en los grandes ríos del país. Estos embalses favorecen el desarrollo económico local y regional, pero también provocan alteraciones graves e irreversibles en el régimen hidrológico natural de los ríos, afectando la calidad del hábitat y la dinámica de la biota. En la zona embalsada, el principal impacto es la transición de agua lótica a léntica, lo que influye en la fauna acuática, incluyendo los peces. Los impactos de los embalses presentan variaciones espaciotemporales relevantes. Inmediatamente después de la formación del embalse, la riqueza de especies de peces suele aumentar debido a la incorporación de hábitats circundantes, pero disminuye a medida que los embalses envejecen. Sin embargo, los impactos aguas abajo de las presas parecen ser similares o más intensos que los que ocurren dentro del embalse. Las presas promueven el control de las descargas, alterando los ciclos estacionales de las inundaciones. Estos efectos se acentúan cuando las presas se construyen en cascada. Por lo tanto, las presas influyen profundamente en la composición y estructura de las comunidades de peces. Las especies más afectadas son las reófilas y las migratorias de larga distancia, que requieren hábitats específicos para completar sus ciclos de vida. Las poblaciones de especies migratorias pueden colapsar o incluso desaparecer en tramos intensamente regulados. Las medidas de gestión adoptadas para minimizar el impacto de las presas en Brasil históricamente han considerado la construcción de pasos para peces, el control de la pesca y la repoblación. Los resultados de estas medidas son cuestionables o han presentado claros fracasos. En este artículo, nos centramos en la cuenca del río Paraná, la más afectada por las presas en Brasil. Describimos algunos patrones en la alteración y disminución de la diversidad de peces en las zonas de influencia de las presas. También analizamos las consecuencias negativas para la pesca y el funcionamiento de los ecosistemas. Finalmente, argumentamos la relevancia y el éxito de las medidas de gestión adoptadas y presentamos algunas sugerencias para mejorar la conservación de la ictiofauna en las cuencas sudamericanas afectadas por las presas.