La trucha mediterránea está catalogada como En Peligro en la Lista Roja de la UICN e incluida en el Anexo II de la Directiva Europea de Hábitats. La extensa contaminación genética debido a la introducción de la trucha atlántica invasora y la degradación del hábitat son algunas de las principales amenazas para la supervivencia de la especie. Nuestros objetivos fueron los siguientes: (i) ofrecer una visión general del estado de conservación actual de la especie en seis áreas piloto italianas (Parques Nacionales o Regionales y sitios de Natura 2000), basado en la investigación realizada en el proyecto LIFE18NAT/IT/000931 STREAMS; (ii) mostrar los resultados resumidos alcanzados a través de una serie de acciones combinadas, destinadas a mejorar el estado de conservación de la especie dentro de un contexto espacial amplio y heterogéneo. Se abordó una estrategia nacional de conservación para la trucha mediterránea, con la intención de proporcionar un marco de gestión que abarque el rango de la especie. Nuestros resultados subrayan la relevancia de un enfoque genético-ecológico multinivel para la preservación de taxones gestionados intensivamente, como los salmónidos, que podría extenderse a otras áreas y especies sujetas a problemas de gestión similares. Además, nuestra investigación enfatiza el papel clave de las áreas protegidas en la detección, recuperación y mantenimiento de poblaciones nativas residuales, que no están exentas de los efectos de los estresores inducidos por el ser humano.