La secuenciación de próxima generación (NGS) ha permitido un conocimiento más profundo del paisaje molecular en el cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC), identificando un número creciente de alteraciones moleculares dirigibles en genes clave. Sin embargo, el perfilado de NGS de biopsias líquidas presenta un riesgo de falsos positivos y falsos negativos, y los parámetros que evalúan la calidad de las llamadas de NGS siguen siendo insuficientes. En este estudio, hemos evaluado el acuerdo porcentual positivo (PPA) entre las llamadas de NGS y PCR digital al evaluar el estado de mutación utilizando 85 muestras de plasma de 82 pacientes con NSCLC positivos. Según nuestros datos, la fracción de alelos variantes (VAF) fue significativamente menor en las llamadas discordantes y la mediana de los valores absolutos de todas las diferencias por pares (MAPD) fue significativamente mayor en las llamadas discordantes (< 0.001 en ambos casos). Basándonos en estos resultados, proponemos un nuevo parámetro que integra ambas variables, llamado R-score. A continuación, buscamos evaluar el PPA para las llamadas de mutación entre dos plataformas de NGS independientes utilizando un subconjunto de 40 muestras de la misma cohorte. Notablemente, hubo una correlación lineal significativa entre el PPA y el R-score (r = 0.97; < 0.001). Específicamente, el PPA de las muestras con un R-score