Aunque hay muchos estudios que han reportado métodos para rastrear el origen geográfico de los productos del mar, la mayoría de ellos se han centrado en identificar parámetros que se pueden usar de manera efectiva y no en la aplicación directa de estos métodos. En este estudio, intentamos diferenciar los orígenes geográficos de la almeja Manila recolectada en diferentes sitios en Corea, la República Popular Democrática de Corea y China utilizando una combinación de análisis basados en isótopos de doble elemento, ácidos grasos (AG) y análisis isotópico específico de compuestos de AG. Hipotetizamos que la aplicación escalonada de nuevos parámetros a muestras no clasificadas podría lograr este objetivo al integrar nueva información mientras se reduce el tiempo y el trabajo. Se encontró que los perfiles de AG y los valores isotópicos de carbono específicos de los AG mejoraron el poder de discriminación para determinar el origen geográfico hasta en un 100%. Nuestros hallazgos demuestran la ventaja de utilizar varios parámetros simultáneamente sobre el método convencional de emplear métodos analíticos individuales al identificar los orígenes geográficos de la almeja Manila, lo cual podría tener implicaciones para rastrear los orígenes de diferentes especies de mariscos u otros productos alimenticios también.