Los receptores tipo Toll (TLRs) han sido implicados en la regulación de diversas vías metabólicas, además de su función en la inmunidad innata. Aquí, investigamos la función metabólica de TLR2 en un sistema de larvas de pez cebra. Estudiamos larvas de un mutante y los controles de tipo salvaje en una condición de desarrollo normal no desafiada utilizando métodos de análisis transcriptómico y metabolómico. Se utilizó RNAseq para evaluar las diferencias transcriptómicas entre las larvas de pez cebra mutantes y de control de tipo salvaje y se encontró un conjunto característico de 149 genes que estaban significativamente alterados en la expresión génica. El nivel de expresión de varios genes fue confirmado por análisis de qPCR. El análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes (GSEA) reveló un enriquecimiento diferencial de genes entre los dos genotipos relacionados con la degradación de valina, leucina e isoleucina y la glucólisis y gluconeogénesis. Utilizando metabolómica por resonancia magnética nuclear (RMN) de hidrógeno, encontramos que la glucosa y varios metabolitos relacionados con el metabolismo de la glucosa estaban presentes en niveles más altos en el mutante. Además, confirmamos que el nivel de glucosa es más alto en los mutantes utilizando un ensayo fluorométrico. Por lo tanto, hemos demostrado que TLR2, además de su función en la inmunidad, tiene una función en el control del metabolismo durante el desarrollo de los vertebrados. Las funciones están asociadas con la regulación transcripcional de varias enzimas involucradas en el metabolismo de la glucosa que podrían explicar los diferentes niveles de glucosa, lactato, succinato y malato en las larvas de un mutante.