La espectroscopía de dicroísmo circular en el cercano UV (CD) es un método ampliamente utilizado que proporciona, entre otros, información sobre la estructura terciaria de sistemas biomoleculares como proteínas, ARN o ADN. Los espectros experimentales de CD en el cercano UV de las proteínas reflejan las señales de CD promediadas sobre las muchas conformaciones que estos sistemas pueden adoptar. Se han desarrollado enfoques teóricos para predecir tales propiedades espectroscópicas y vincular las conformaciones modeladas de biosistemas complejos a datos experimentales fácilmente accesibles, sin tener que recurrir a costosas técnicas de biología estructural. Sin embargo, estas predicciones se generan principalmente sobre la base de una única estructura experimental, lo que hace falta la información dinámica que refleja la variabilidad conformacional de la proteína. Aquí, describimos una reformulación completa de los fundamentos teóricos detrás de la predicción de espectros de CD. Proponemos un pipeline automatizado basado en QM/MM que genera un espectro promedio de CD en el cercano UV a partir de un conjunto de MD dado de manera rápida, basándose en estas consideraciones teóricas y lo probamos además en sistemas de proteínas. Este pipeline ha sido implementado en un programa de código abierto llamado.