El humedal de Zhalong se ve afectado por la deposición elevada de nitrógeno (N) atmosférico y las entradas de N de la fertilización agrícola, lo que a su vez afecta las emisiones de gases de efecto invernadero (GEI). No está claro cómo la adición de N afecta las emisiones de óxido nitroso (NO) y dióxido de carbono (CO) en este humedal. Por lo tanto, realizamos un experimento a corto plazo, recolectando muestras de suelo de tres puntos representativos con diferentes niveles de agua, y se utilizaron cinco niveles de adición de N (N0 = 0 mg N kg, N10 = 10 mg N kg, N30 = 30 mg N kg, N50 = 50 mg N kg, N100 = 100 mg N kg) para simular la entrada de N. En general, las emisiones de NO aumentaron significativamente con la adición de N. De manera diferente, la adición de N tuvo un efecto supresor significativo sobre las emisiones de CO en suelos con alta inundación, mientras que las emisiones más altas de CO se observaron bajo el tratamiento N30 en suelos de inundación media y secos. A través del análisis de correlación de Pearson, encontramos una correlación positiva significativa entre las emisiones de NO y el amonio (NH), y la emisión de CO estuvo significativamente correlacionada positivamente con el pH y el carbono orgánico total (TOC). Mientras tanto, se analizó la comunidad bacteriana del suelo mediante secuenciación de alto rendimiento. Los resultados revelaron que la adición de N no afectó significativamente la estructura de la comunidad bacteriana del suelo, mientras que los tres puntos eran significativamente diferentes. Entre ellos, la abundancia relativa de los géneros dominantes se vio significativamente aumentada después de la adición de N. Además, se encontró que las comunidades bacterianas estaban significativamente correlacionadas con el pH del suelo, TOC, NH y los contenidos de nitrato, lo que afectó las emisiones de NO y CO.