El exceso de zinc (estrés por Zn) podría llevar a efectos perjudiciales en las plantas, como un aumento en la producción de ROS, la inhibición de la maquinaria fotosintética y el deterioro de la absorción de nutrientes. Por lo tanto, nuestro objetivo fue investigar la complejidad de las respuestas metabólicas al estrés por Zn en hojas jóvenes y maduras, así como en raíces, mediante proteómica. Nuestra investigación previa en metabolómica ha indicado la posible participación de gluconato y salicilato en los mecanismos de tolerancia al Zn. Sin embargo, el estudio proteómico de los ajustes metabólicos subyacentes a la tolerancia al estrés por Zn puede proporcionar información adicional sobre el tema, ya que se sabe que muchas enzimas se ven afectadas por el exceso de metales de transición. Los resultados obtenidos a través de la proteómica de abajo hacia arriba fueron complementarios a nuestros datos anteriores de metabolómica y, además, iluminaron otros detalles importantes en la respuesta metabólica de las plantas al estrés por Zn aplicado. En particular, se mostró la participación significativa de enzimas relacionadas con el redox, especialmente en las raíces, y se podrían proponer sus posibles interacciones con la señalización de salicilato y jasmonato. Además, los cambios inducidos por Zn en raíces y hojas jóvenes afectaron fuertemente el metabolismo de azúcares, mejoraron el sistema de control de calidad de proteínas, mientras que las hojas maduras se caracterizaron por una notable disminución en las subunidades de los complejos de transporte de electrones fotosintéticos. Así, este trabajo enfatiza una reprogramación metabólica masiva destinada a reforzar las respuestas de defensa de las raíces mientras se apoya a las hojas jóvenes con metabolitos de azúcar. Los datos de proteómica por espectrometría de masas están disponibles a través de ProteomeXchange con el identificador PXD069557.