Los genes son esenciales para el desarrollo de las plantas y el metabolismo secundario. La mayoría de los genes dentro de un genoma existen en una familia de genes, cada una con funciones específicas. El ginseng es una hierba utilizada en medicina por sus posibles beneficios para la salud. La familia de genes en el ginseng de Jilin no ha sido estudiada. Este estudio investigó la evolución y la diversificación estructural y funcional de la familia de genes utilizando bioinformática y analizó la expresión génica a través de la regulación por metil jasmonato (MeJA). Los resultados revelaron que la evolución de la familia de genes se diversificó en diez clústeres de un árbol filogenético construido, de los cuales el clúster más prevalente tiene un mayor número de genes. A pesar de sus distintos clústeres evolutivos, un número significativo de miembros contiene motivos conservados comunes. La familia de genes se diferenció funcionalmente en tres categorías funcionales principales: proceso biológico, función molecular y componente celular. Su expresión es variable dentro de un tejido, en una etapa de desarrollo y en cultivares. Independientemente de la diversidad de las funciones de los genes y su evolución, su expresión se correlacionó y formó una red de coexpresión génica. Los análisis de redes de coexpresión génica ponderada identificaron genes clave que podrían estar regulando la biosíntesis de ginsenosidos. Curiosamente, la familia también está involucrada en la regulación por MeJA. Estos hallazgos proporcionan una referencia valiosa para futuras investigaciones sobre genes.