No hay duda de que el conocimiento actual en química, bioquímica, biología y matemáticas ha llevado a avances en nuestra comprensión sobre los alimentos y los sistemas alimentarios. Sin embargo, el llamado enfoque reduccionista ha dominado la investigación alimentaria, obstaculizando nuevos desarrollos e innovaciones en el campo. En las últimas tres décadas, la ciencia de los alimentos ha ingresado a la era digital y tecnológica, lo que ha inducido varios desafíos derivados del uso de técnicas instrumentales modernas, computación y algoritmos incorporados a la exploración, extracción y descripción de datos derivados de esta complejidad. En este entorno, los científicos de alimentos deben ser conscientes de los problemas (ventajas y desventajas) involucrados en las aplicaciones rutinarias de la quimiometría. El objetivo de este documento de opinión es dar una visión general de los problemas clave asociados con la implementación de la quimiometría en la investigación y desarrollo de alimentos. Por favor, tenga en cuenta que los detalles sobre las diferentes metodologías y técnicas están fuera del alcance de esta revisión.