En la actualidad, el software clínico está revolucionando la práctica sanitaria al proporcionar a los profesionales de la salud herramientas informáticas avanzadas que emplean algoritmos sofisticados y registros médicos electrónicos, lo que facilita el seguimiento farmacoterapéutico, especialmente en la gestión de medicamentos críticos como los antibióticos y los anticoagulantes en pacientes hospitalizados. La importancia de este estudio se deriva de dos problemas graves: la resistencia a los antimicrobianos (RAM) y los eventos adversos relacionados con los anticoagulantes. Según datos de la Organización Mundial de la Salud (OMS), la RAM es responsable de más de 700 000 muertes al año, lo que consolida su posición como un reto crítico para la salud pública. Además, los anticoagulantes generan aproximadamente el 25 % de los eventos adversos relacionados con los medicamentos, muchos de los cuales se pueden prevenir. Esta investigación tiene como objetivo revisar la literatura sobre los beneficios de diversas herramientas de TI para la gestión de antibióticos y anticoagulantes en la monitorización farmacoterapéutica hospitalaria. Se llevó a cabo una revisión sistemática siguiendo la guía metodológica establecida por el Instituto Joanna Briggs (JBI) para este tipo de estudios. Esta guía metodológica garantizó la coherencia y la transparencia del proceso de revisión. Los programas de gestión de antimicrobianos son herramientas clave en los sistemas de salud para reducir los daños derivados del uso inadecuado de antimicrobianos. La gestión de los antibióticos mediante herramientas de tecnología de la información, como la Red de Competencia en Telemedicina, los sistemas de información hospitalaria, la prescripción electrónica y los sistemas de apoyo a la decisión clínica (CDSS), optimiza la prescripción al generar alertas en tiempo real, supervisar los patrones de resistencia y ajustar las dosis en función de la farmacocinética, lo que reduce los errores de prescripción en un 30 %. Los algoritmos del software clínico también mejoran la documentación y el uso seguro de los anticoagulantes. La optimización del uso de anticoagulantes mediante modelos multidisciplinarios, CDSS, sistemas hospitalarios y recetas electrónicas ha sido crucial, ya que estos fármacos representan el 16 % de los errores médicos hospitalarios. En general, el software clínico mejora los resultados, reduciendo el uso de antibióticos en un 20 %, el uso inadecuado de anticoagulantes y los reingresos en un 16 % en un plazo de 6 meses. Sin embargo, siguen existiendo retos, como la privacidad de los datos, la integración de los sistemas y la aceptación por parte de los médicos, lo que requiere estrategias multifacéticas para una adopción eficaz.