La tasa de éxito del tratamiento de conductos radiculares es alta, pero puede fallar. En estos casos, el retratamiento ortogrado del conducto radicular es a menudo el tratamiento de elección, para el cual hay numerosos biomateriales disponibles en el mercado, incluidos los instrumentos endodónticos. Esta revisión sistemática tuvo como objetivo estudiar los instrumentos endodónticos disponibles en el mercado y establecer su eficacia en el retratamiento del conducto radicular. Se realizó una búsqueda electrónica en seis bases de datos diferentes, y se seleccionaron estudios experimentales in vitro que estudiaron la limpieza del conducto radicular, la extrusión de desechos, el tiempo de retratamiento o el daño dentinario producido con cualquiera de los métodos de comparación. La calidad de los estudios se evaluó con la escala QUIN. En total, se incluyeron 78 estudios para el análisis, de los cuales 9 tenían un alto riesgo de sesgo, 53 tenían un riesgo moderado y 16 tenían un bajo riesgo. Los métodos utilizados para evaluar la eficacia de los instrumentos endodónticos en el retratamiento del conducto radicular son heterogéneos. Los instrumentos manuales producen más extrusión apical que los instrumentos rotatorios. Los instrumentos PTUR son los instrumentos endodónticos más estudiados. Es el sistema de instrumentos que deja la menor cantidad de material de obturación residual en el conducto, toma el menor tiempo durante el retratamiento y elimina la mayor cantidad de dentina. Sin embargo, ningún sistema de instrumentos logró la eliminación completa del material de obturación del conducto radicular. No surgió un patrón consistente en los estudios al comparar los instrumentos rotatorios con rotación continua y reciprocante en términos de la eliminación del material de obturación, el tiempo requerido para la de-obturación, el daño dentinario producido o la extrusión apical.