La llanura aluvial del Alto Paraná se encuentra en una región del bioma Mata Atlántica, un área crítica para la conservación. Debido a la escasez de investigaciones sobre la quirópterofauna en esta región, el presente estudio investigó la riqueza y abundancia de especies de murciélagos en remanentes del bosque semidecidual estacional del Alto Paraná, en el sur de Brasil. Se realizaron muestreos mensuales, de enero a diciembre de 2006, utilizando 32 redes de niebla de 8,0 × 2,5 m, con un rendimiento de 640 m²/h y un esfuerzo de captura total de 87.040 m²/h. Para estimar la riqueza de especies, se emplearon los estimadores Chao1 y Jack2. Durante el estudio, un total de 563 personas pertenecientes a 17 especies (Artibeus planirostris, Artibeus lituratus, Carollia perspicillata, Platyrrhinus lineatus, Sturnira lilium, Artibeus fimbriatus, Myotis nigricans, Desmodus rotundus, Artibeus obscurus, Noctilio albiventris, Phylostomus decolorar, Phylostomus hastatus, Chrotopterus auritus, Lasiurus ega, Chiroderma villosum, Pygoderma bilabiatum y Lasiurus blossevillii) fueron capturados. Las curvas de riqueza estimadas tendieron a estabilizarse, lo que indica que la mayoría de se muestrearon las especies. Las especies capturadas representaron el 10% de los taxones registrados en Brasil y el 28% en el estado de Paraná. revelando la importancia de esta zona para la diversidad de murciélagos. Estos hallazgos indican la necesidad de determinar acciones que apunten a restringir las actividades humanas en estos fragmentos de bosque, con el fin de minimizar los impactos antropogénicos sobre la quiropterofauna.