La deposición de grasa es un factor importante que afecta la calidad de la carne y la eficiencia de conversión alimenticia en patos de carne. Este estudio tiene como objetivo identificar circARNs y genes clave que afectan la deposición de grasa abdominal. Se analizaron las correlaciones entre la grasa abdominal y otros rendimientos de crecimiento en 304 patos Cherry Valley de la generación F, y se realizó un análisis de RNA-seq de tejidos de grasa abdominal de patos con altas y bajas tasas de grasa abdominal. Los resultados del rendimiento de crecimiento mostraron que la proporción de grasa abdominal y la grasa intramuscular eran significativamente más altas en el grupo de altas tasas de grasa abdominal (HF) que en el grupo de bajas tasas de grasa abdominal (LF) para los patos. El análisis de RNA-seq del tejido de grasa abdominal reveló 85 circARNs sobreexpresados y 72 circARNs subexpresados entre los que se expresaron diferencialmente. Notablemente, 74 circARNs mostraron una expresión diferencial de más de cuatro veces, constituyendo el 47.13% de los genes expresados diferencialmente. El análisis de enriquecimiento funcional de los genes fuente y objetivo de circARNs expresados diferencialmente indicó que 17 circARNs podrían participar en la regulación de la producción de grasa abdominal en patos al influir en vías como la señalización de PPAR, las gotas lipídicas y el metabolismo de triglicéridos. Por último, se construyeron múltiples redes de interacción circARN-microARN-ARN mensajero. Los resultados de este estudio establecen las bases para comprender los mecanismos moleculares que regulan la deposición de grasa abdominal en patos, ofreciendo una referencia teórica para la cría selectiva de patos de alta calidad para la producción de carne.