El análisis de los cambios en la expresión génica a través del genoma proporciona una herramienta poderosa y objetiva para obtener información sobre los mecanismos moleculares. Hemos utilizado eficazmente la secuenciación de ARN para identificar genes expresados diferencialmente en mutantes genéticos de larga vida para avanzar en nuestra comprensión de las vías genéticas que controlan la longevidad. Aunque los costos de la secuenciación de ARN han disminuido, el costo sigue siendo una barrera para examinar múltiples cepas y puntos temporales con un número suficiente de réplicas biológicas. Para sortear esto, hemos examinado la eficacia de identificar genes expresados diferencialmente secuenciando una muestra de ARN agrupada de gusanos mutantes mitocondriales de larga vida. Encontramos que la secuenciación de una muestra de ARN agrupada podría identificar eficazmente genes que se encontraron significativamente regulados al alza en los dos experimentos de secuenciación de ARN individuales. Finalmente, comparamos los genes significativamente regulados al alza en los dos experimentos de secuenciación de ARN individuales con dos experimentos de microarreglos anteriores para elaborar una lista de alta confianza de genes modulados en gusanos mutantes de larga vida. En general, este trabajo demuestra que la secuenciación de ARN de muestras de ARN agrupadas se puede utilizar para identificar genes expresados diferencialmente.