Los estrés abióticos en las plantas son la principal causa de pérdidas significativas en los cultivos a nivel mundial. El musgo es altamente tolerante a diferentes tipos de estrés abiótico, como la deshidratación. Nuestro grupo está interesado en identificar y caracterizar genes expresados diferencialmente en respuesta al estrés abiótico en esta especie. Sin embargo, es esencial contar con una colección de genes de referencia validados para el análisis de RT-qPCR para normalizar la expresión de los genes en respuesta a las condiciones de interés. Aquí, evaluamos 13 genes de referencia candidatos basados en su estabilidad de expresión a través de transcriptomas de seis condiciones relacionadas con el estrés abiótico utilizando los programas RefFinder, BestKeeper, geNorm y NormFinder. La estabilidad y fiabilidad de los genes de referencia propuestos se evaluaron bajo seis condiciones experimentales: control, deshidratación, rehidratación, ácido abscísico (ABA), NaCl y sorbitol. Curiosamente, la mayoría de los genes de referencia propuestos mostraron alta estabilidad (bajos valores de M) en todas las condiciones de estrés abiótico analizadas. Un análisis de variación por pares indicó que solo un par es necesario para normalizar los experimentos de RT-qPCR. Se confirmó que cada gen normaliza la expresión de genes tanto sobreexpresados como subexpresados. Este representa el primer informe de genes de referencia validados para estudios de expresión génica por RT-qPCR bajo estrés abiótico en el tejido protonemal de un musgo completamente tolerante a la deshidratación.