La colonización temprana de la microbiota intestinal neonatal es vital para el desarrollo del sistema inmunológico y la salud en general, ya que una microbiota equilibrada apoya la maduración de los sistemas digestivo y metabólico. Nuestro estudio investigó si el modo de entrega afecta la composición de la microbiota intestinal en neonatos caninos, examinando específicamente el impacto de la siembra vaginal en aquellos nacidos por cesárea electiva. Aunque la transmisión vertical fue significativa, el modo de entrega no emergió como un determinante principal de las diferencias en la microbiota, y la siembra vaginal fue ineficaz para modular la microbiota de los neonatos nacidos por cesárea. Sugerimos más investigaciones sobre el eje intestino-cerebro para comprender mejor el desarrollo temprano de la microbiota relacionado con los diferentes métodos de entrega.