Simulación dinámica molecular para explorar la base molecular de la interacción del dominio Btk-PH con Ins(1,3,4,5)P4.
Autores: Lu, Dan; Jiang, Junfeng; Liang, Zhongjie; Sun, Maomin; Luo, Cheng; Shen, Bairong; Hu, Guang
Idioma: Inglés
Editor: Hindawi Publishing Corporation
Año: 2013
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Bioingeniería
Palabras clave
Brutons
Tirosina quinasa
Dominio de homología de pleckstrin
Inositol 1
3
4
5-tetrakisfosfato
Mutantes
Sitio de unión
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Consultas: 21
Citaciones: Sin citaciones
La tirosina quinasa de Bruton contiene un dominio de homología de pleckstrina y se une específicamente al inositol 1,3,4,5-tetrakisfosfato (Ins(1,3,4,5)P4), el cual está involucrado en la maduración de las células B. En este artículo, estudiamos 12 sistemas que incluyen el tipo salvaje y 11 mutantes, K12R, S14F, K19E, R28C/H, E41K, L11P, F25S, Y40N y K12R-R28C/H, para investigar cualquier cambio en el sitio de unión del ligando de cada mutante. Se han aplicado simulaciones de dinámica molecular combinadas con el método de mecánica molecular/área de superficie accesible al solvente Poisson-Boltzmann a los doce sistemas, y se han obtenido estructuras mutantes razonables y sus energías libres de unión como criterios en la clasificación final. Como resultado, cinco estructuras, los mutantes K12R, K19E, R28C/H y
Descripción
La tirosina quinasa de Bruton contiene un dominio de homología de pleckstrina y se une específicamente al inositol 1,3,4,5-tetrakisfosfato (Ins(1,3,4,5)P4), el cual está involucrado en la maduración de las células B. En este artículo, estudiamos 12 sistemas que incluyen el tipo salvaje y 11 mutantes, K12R, S14F, K19E, R28C/H, E41K, L11P, F25S, Y40N y K12R-R28C/H, para investigar cualquier cambio en el sitio de unión del ligando de cada mutante. Se han aplicado simulaciones de dinámica molecular combinadas con el método de mecánica molecular/área de superficie accesible al solvente Poisson-Boltzmann a los doce sistemas, y se han obtenido estructuras mutantes razonables y sus energías libres de unión como criterios en la clasificación final. Como resultado, cinco estructuras, los mutantes K12R, K19E, R28C/H y