Hoy en día, la síntesis de ARN se ha convertido en una herramienta esencial no sólo en el campo de la biología molecular y la medicina, sino también en áreas como el diagnóstico molecular y las ciencias de los materiales. Más allá de los ARN sintéticos para las tecnologías de antisentido, aptámeros, ribozimas y ARNsi, se necesitan oligorribonucleótidos que lleven modificaciones en sitios específicos para estudios de estructura y función. Para ello, a menudo es necesario etiquetar el ARN con un grupo espectroscópico informador adecuado. En este trabajo describimos la síntesis de bloques monoméricos funcionalizados que, una vez incorporados al ARN, permiten la reacción selectiva con una entidad funcional o informadora específica. En particular, informamos sobre la síntesis de 5′-O-dimetoxitritil-2′-O-terc-butildimetilsilil 3′-O-fosforamiditos protegidos de nucleósidos que llevan enlaces amino de diferentes longitudes y flexibilidad en la base heterocíclica, su incorporación en una variedad de ARN, y la conjugación postsintética con colorantes fluorescentes y etiquetas de espín de nitróxido. Además, mostramos la síntesis de un éster N-hidroxi-succinimidílico de mononucleótido de flavina y su conjugación con ARN aminofuncionalizado.