La timoquinona es un producto natural, el principal constituyente de las semillas, que exhibe actividades antiinflamatorias y anticancerígenas. Entre varias moléculas existentes capaces de formar una estructura de compuesto de inclusión, los ciclodextrinas se aplican en la industria farmacéutica ya sea para aumentar la solubilidad de moléculas hidrofóbicas o para proteger moléculas de la inactivación o degradación. La -ciclodextrina es actualmente la ciclodextrina más común en formulaciones farmacéuticas y probablemente la mejor estudiada en humanos. Para estudiar las propiedades de compuestos de inclusión basados en ciclodextrinas y timoquinona se utilizaron espectroscopías de Transformada de Fourier Infrarroja (FTIR), Ultravioleta-Visible, de Aniquilación de Positrones (PAL) y estudios calorimétricos mediante Calorimetría Diferencial de Barrido (DSC). Los resultados obtenidos indican la formación de un compuesto de inclusión 1:1 entre la ciclodextrina y la timoquinona. Las medidas de PAL y DSC también proporcionaron evidencia de la actividad del compuesto de inclusión.