Una nueva interacción proteica entre el dominio de unión a nucleótidos de Hsp70 y el motivo p53
Autores: Asita, Elengoe; Mohammed Abu, Naser; Salehhuddin, Hamdan
Idioma: Inglés
Editor: Hindawi Publishing Corporation
Año: 2015
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
Actualmente, la interacción proteica del dominio de unión a nucleótidos (NBD) del Homo sapiens de la proteína de choque térmico de 70 kDa (PDB: 1HJO) con el motivo p53 sigue sin dilucidarse. El complejo NBD-motivo p53 potencia la estabilización de p53, aumentando así la actividad de supresión tumoral en el tratamiento del cáncer. Por lo tanto, identificamos la interacción entre NBD y p53 utilizando el programa STRING versión 9.1. A continuación, modelamos la interacción tridimensional entre NBD y p53. A continuación, modelamos la estructura tridimensional del motivo p53 mediante modelado homológico y determinamos la afinidad de unión y la estabilidad de la estructura del complejo NBD-motivo p53 mediante simulación de acoplamiento molecular y dinámica (MD). El dominio humano de unión al ADN del motivo p53 (SCMGGMNR) recuperado de UniProt (UniProtKB: P04637) se acopló a la proteína NBD, utilizando el programa Autodock versión 4.2. La energía de unión y la estabilidad intermolecular de la estructura del complejo NBD-p53 se determinaron mediante simulación dinámica y molecular (MD). La energía de enlace y la energía intermolecular del complejo NBD-p53 fueron de -0,44 Kcal/mol y -9,90 Kcal/mol, respectivamente. Además, los análisis de RMSD, RMSF, enlaces de hidrógeno, puente salino y estructura secundaria revelaron que la proteína NBD tenía un fuerte enlace con el motivo p53 y que el complejo proteína-ligando era estable. Así pues, los datos actuales serían muy alentadores para el diseño de fármacos basados en la estructura de Hsp70 en la terapia del cáncer.
Descripción
Actualmente, la interacción proteica del dominio de unión a nucleótidos (NBD) del Homo sapiens de la proteína de choque térmico de 70 kDa (PDB: 1HJO) con el motivo p53 sigue sin dilucidarse. El complejo NBD-motivo p53 potencia la estabilización de p53, aumentando así la actividad de supresión tumoral en el tratamiento del cáncer. Por lo tanto, identificamos la interacción entre NBD y p53 utilizando el programa STRING versión 9.1. A continuación, modelamos la interacción tridimensional entre NBD y p53. A continuación, modelamos la estructura tridimensional del motivo p53 mediante modelado homológico y determinamos la afinidad de unión y la estabilidad de la estructura del complejo NBD-motivo p53 mediante simulación de acoplamiento molecular y dinámica (MD). El dominio humano de unión al ADN del motivo p53 (SCMGGMNR) recuperado de UniProt (UniProtKB: P04637) se acopló a la proteína NBD, utilizando el programa Autodock versión 4.2. La energía de unión y la estabilidad intermolecular de la estructura del complejo NBD-p53 se determinaron mediante simulación dinámica y molecular (MD). La energía de enlace y la energía intermolecular del complejo NBD-p53 fueron de -0,44 Kcal/mol y -9,90 Kcal/mol, respectivamente. Además, los análisis de RMSD, RMSF, enlaces de hidrógeno, puente salino y estructura secundaria revelaron que la proteína NBD tenía un fuerte enlace con el motivo p53 y que el complejo proteína-ligando era estable. Así pues, los datos actuales serían muy alentadores para el diseño de fármacos basados en la estructura de Hsp70 en la terapia del cáncer.