Dentro de una especie de planta leñosa, la heterogeneidad ambiental tiene el potencial de influir en la distribución de la variación genética entre poblaciones a través de varios procesos evolutivos. En algunas especies puede detectarse una relación entre las características ambientales y la distribución de los genotipos, lo que demuestra la importancia de la selección natural como principal fuente de diferenciación. Nothofagus dombeyi (Mirb.) Oerst. (Nothofagaceae) es una especie arbórea endémica de los bosques templados de Chile y Argentina. La historia postglacial se ha estudiado con ADN de cloroplastos y las fuerzas evolutivas que determinan los patrones de variación genética se han analizado con isozimas, pero se necesitan estudios de diversidad genética a escala fina. El estudio de las historias demográficas y de selección en Nothofagus dombeyi requiere marcadores más informativos, como los polimorfismos de nucleótido único (SNP). Las herramientas de genotipado por secuenciación permiten ahora estudiar miles de marcadores SNP a precios razonables en especies no modelo. Hemos investigado más de 10.000 loci SNP en busca de señales de adaptación local y hemos demostrado que la interrogación de los recursos genómicos puede identificar cambios en la diversidad genética y señales adaptativas putativas en esta especie leñosa no modelo.