La leishmaniasis es una enfermedad parasitaria causada por flagelados protozoarios del género. Recientemente, se aislaron especies emergentes de pacientes en Tailandia. Se demanda el desarrollo de la vacuna; sin embargo, las diferencias genéticas entre las dos especies dificultan el diseño de una vacuna que sea efectiva para ambas. En este estudio, aplicamos enfoques inmunoinformáticos para diseñar una vacuna quimérica de múltiples epítopos (CMEV) contra ambas. Identificamos siete epítopos de linfocitos T ayudantes (HTL), dieciséis epítopos de linfocitos T citotóxicos (CTL) y once epítopos de células B de dieciséis proteínas antigénicas conservadas encontradas en ambas especies. Todos estos epítopos se unieron y, para mejorar aún más la inmunogenicidad, se añadieron adyuvantes de proteínas y péptidos en el extremo N-terminal de la molécula utilizando enlaces específicos. El candidato CMEV fue posteriormente analizado desde las perspectivas de la antigenicidad, alergenicidad y propiedades fisicoquímicas. La interacción de la vacuna de múltiples epítopos diseñada y el receptor inmune (TLR4) del huésped se evaluó en función de los acoplamientos moleculares de las estructuras 3D predichas. Finalmente, se realizó clonación in silico para construir el vector de expresión de la vacuna. El análisis de acoplamiento mostró que el complejo vacuna/TLR4 tomó una forma estable. Basado en la inmunogenicidad predicha, propiedades fisicoquímicas y estructurales in silico, se esperaba que el candidato a vacuna se expresara adecuadamente en sistemas de expresión bacteriana y mostrara el potencial para inducir una respuesta inmune del huésped. Este estudio propone la validación experimental de la eficacia del constructo de la vacuna candidata contra las dos.