Los loros del género Amazona se encuentran entre las especies más amenazadas del orden Pscittaciformes. Este trabajo describe polimorfismos de alozimas en tres especies de loros amazónicos: la Amazona de Frente Azul (Amazona aestiva), la Amazona de Alas Naranjas (Amazona amazonica) y la Amazona Festiva (Amazona festiva), y proporciona datos útiles para la evaluación de su variabilidad genética. Analizamos electroforéticamente muestras de sangre de 68 individuos capturados en la naturaleza, mantenidos en cautiverio en tres zoológicos brasileños. Ocho de los diez loci enzimáticos estudiados presentaron polimorfismo. La glucosa fosfato isomerasa (Gpi) resultó ser un locus diagnóstico para la identificación de estas especies amazónicas. La heterocigosidad promedio esperada de la Amazona de Frente Azul (0,060) difirió significativamente de las heterocigosidades esperadas de la Amazona de Alas Naranjas y la Amazona Festiva (0,040 y 0,039, respectivamente). Este resultado se discutió como consecuencia de la hibridación entre dos subespecies geográficas de A. aestiva y, alternativamente, como un rasgo particular de esta especie. La variabilidad genética de la Amazona Frentiazul, en comparación con las aves en general, no es baja a nivel de especie, a pesar de que este loro es una de las especies con mayor comercio ilegal. El análisis de alozimas demostró ser una herramienta útil para monitorear la variación genética dentro del género Amazona y puede aplicarse en el programa de manejo de otras especies amenazadas de este género.