El desarrollo de soluciones bioinformáticas está guiado por el conocimiento biológico del tema. En algunos casos, utilizamos modelos biológicos inequívocos, mientras que en otros nos basamos en suposiciones. Una suposición comúnmente utilizada para los genomas es que las especies relacionadas tienen secuencias genómicas similares. Esto es aún más obvio en el caso de los genomas de cloroplastos debido a su lenta evolución. Investigamos si las longitudes de las secuencias completas de cloroplastos están estrechamente relacionadas con la proximidad taxonómica de las especies. El estudio se realizó utilizando todas las secuencias disponibles de los clados asterid y rosid. En general, las distribuciones de longitud de los cloroplastos son estrechas tanto a nivel de familia como de género. Además, ya se han reportado explicaciones biológicas claras para familias y géneros que exhiben distribuciones particularmente amplias. Los principales factores responsables de las variaciones en la longitud son las formas de vida parasitarias, la pérdida de IR, las expansiones y contracciones de IR, y la polifilia. Sin embargo, la presencia de valores atípicos en la distribución a nivel de género es una fuerte indicación de posibles inexactitudes en el ensamblaje de secuencias.