Variación Inter-Individual en los Patrones de Metilación del ADN a través de Dos Tejidos y Leucocitos en Ganado Brahman Maduro
Autores: Baker, Emilie C.; San, Audrey E.; Cilkiz, Kubra Z.; Littlejohn, Brittni P.; Cardoso, Rodolfo C.; Ghaffari, Noushin; Long, Charles R.; Riggs, Penny K.; Randel, Ronald D.; Welsh, Thomas H.; Riley, David G.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
Cuantificar la variación natural interindividual en los patrones de metilación del ADN es importante para identificar su contribución a la variación fenotípica, pero también para entender cómo el ambiente afecta la variabilidad y para su incorporación en análisis estadísticos. La variación interindividual en los patrones de metilación del ADN en vacas hembras y el efecto que un estresor prenatal tiene sobre dicha variabilidad aún no se ha cuantificado. Así, el objetivo de este estudio fue utilizar datos de metilación de hembras Brahman maduras para cuantificar la variación interindividual en la metilación del ADN. Las vacas Brahman embarazadas fueron transportadas durante 2 horas en los días 60 +/- 5; 80 +/- 5; 100 +/- 5; 120 +/- 5; y 140 +/- 5 de gestación. Se mantuvo un grupo no transportado como control. Se recolectaron leucocitos, amígdala y glándulas pituitarias anteriores de ocho vacas nacidas del grupo no transportado (Control) y seis del grupo transportado (PNS) a los 5 años de edad. El ADN recolectado de la pituitaria anterior contenía la mayor variabilidad en la metilación del ADN de sitios de citosina-fosfato-guanina (mCpG) de ambos grupos, PNS y Control, y la amígdala tenía la menor. Numerosos sitios mCpG variables estaban asociados con elementos retrotransponibles y regiones altamente repetitivas del genoma. Algunas de las características genómicas que presentaron alta variación en la metilación del ADN están involucradas en respuestas inmunitarias, señalización, respuestas a estímulos y procesos metabólicos. La pequeña superposición de sitios CpG altamente variables y características entre tejidos y leucocitos respalda el papel de la metilación variable del ADN en la regulación de la expresión génica específica de tejidos. Muchos de los sitios CpG que exhibieron alta variabilidad en la metilación del ADN eran comunes entre los grupos PNS y Control dentro de un tejido, pero había poca superposición en las características genómicas con alta variabilidad. La interacción entre el ambiente prenatal y el genoma podría ser responsable de las diferencias en la ubicación de la metilación variable del ADN.
Descripción
Cuantificar la variación natural interindividual en los patrones de metilación del ADN es importante para identificar su contribución a la variación fenotípica, pero también para entender cómo el ambiente afecta la variabilidad y para su incorporación en análisis estadísticos. La variación interindividual en los patrones de metilación del ADN en vacas hembras y el efecto que un estresor prenatal tiene sobre dicha variabilidad aún no se ha cuantificado. Así, el objetivo de este estudio fue utilizar datos de metilación de hembras Brahman maduras para cuantificar la variación interindividual en la metilación del ADN. Las vacas Brahman embarazadas fueron transportadas durante 2 horas en los días 60 +/- 5; 80 +/- 5; 100 +/- 5; 120 +/- 5; y 140 +/- 5 de gestación. Se mantuvo un grupo no transportado como control. Se recolectaron leucocitos, amígdala y glándulas pituitarias anteriores de ocho vacas nacidas del grupo no transportado (Control) y seis del grupo transportado (PNS) a los 5 años de edad. El ADN recolectado de la pituitaria anterior contenía la mayor variabilidad en la metilación del ADN de sitios de citosina-fosfato-guanina (mCpG) de ambos grupos, PNS y Control, y la amígdala tenía la menor. Numerosos sitios mCpG variables estaban asociados con elementos retrotransponibles y regiones altamente repetitivas del genoma. Algunas de las características genómicas que presentaron alta variación en la metilación del ADN están involucradas en respuestas inmunitarias, señalización, respuestas a estímulos y procesos metabólicos. La pequeña superposición de sitios CpG altamente variables y características entre tejidos y leucocitos respalda el papel de la metilación variable del ADN en la regulación de la expresión génica específica de tejidos. Muchos de los sitios CpG que exhibieron alta variabilidad en la metilación del ADN eran comunes entre los grupos PNS y Control dentro de un tejido, pero había poca superposición en las características genómicas con alta variabilidad. La interacción entre el ambiente prenatal y el genoma podría ser responsable de las diferencias en la ubicación de la metilación variable del ADN.