Se espera que el cambio global modifique la amenaza que representan los patógenos para las plantas. Sin embargo, se sabe poco sobre cómo un clima cambiante influirá en la epidemiología de las enfermedades transmitidas por vectores generalistas. Desarrollamos un método de detección de alto rendimiento para probar la presencia de un patógeno vegetal mortal en sus vectores insectos. Luego, utilizando datos de una encuesta de cuatro años en áreas climáticamente distintas de Córcega (Francia), demostramos una correlación positiva entre la proporción de vectores positivos y la temperatura. Notablemente, una mayor prevalencia correspondió con inviernos más suaves. Nuestras proyecciones hasta 2100 indican un aumento del riesgo de brotes. Si bien se espera que la proporción de vectores que transportan el patógeno aumente, las condiciones climáticas seguirán siendo adecuadas para la bacteria y su principal vector, con posibles desplazamientos hacia elevaciones más altas. Además de solicitar esfuerzos de investigación para limitar la incidencia de enfermedades vegetales en la zona templada, este trabajo revela que las tecnologías moleculares recientes podrían y deberían ser utilizadas para la detección masiva de patógenos en vectores para aumentar los esfuerzos de vigilancia y gestión.